Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccl20O89093 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccl20O89093 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccl20O89093 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccl20O89093 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccl20O89093 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl20O89093 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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