Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GcatO88986 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GcatO88986 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GcatO88986 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GcatO88986 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GcatO88986 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GcatO88986 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcatO88986 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcatO88986 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcatO88986 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcatO88986 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcatO88986 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GcatO88986 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GcatO88986 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GcatO88986 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GcatO88986 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GcatO88986 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GcatO88986 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GcatO88986 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GcatO88986 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GcatO88986 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GcatO88986 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GcatO88986 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GcatO88986 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GcatO88986 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GcatO88986 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GcatO88986 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GcatO88986 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GcatO88986 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GcatO88986 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GcatO88986 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GcatO88986 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GcatO88986 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GcatO88986 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GcatO88986 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GcatO88986 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GcatO88986 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GcatO88986 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GcatO88986 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GcatO88986 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GcatO88986 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GcatO88986 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GcatO88986 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GcatO88986 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GcatO88986 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GcatO88986 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GcatO88986 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GcatO88986 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GcatO88986 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GcatO88986 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GcatO88986 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GcatO88986 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GcatO88986 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GcatO88986 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GcatO88986 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GcatO88986 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GcatO88986 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GcatO88986 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GcatO88986 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GcatO88986 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GcatO88986 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GcatO88986 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GcatO88986 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GcatO88986 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GcatO88986 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GcatO88986 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GcatO88986 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GcatO88986 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GcatO88986 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GcatO88986 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GcatO88986 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GcatO88986 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GcatO88986 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GcatO88986 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GcatO88986 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GcatO88986 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GcatO88986 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GcatO88986 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GcatO88986 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GcatO88986 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GcatO88986 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GcatO88986 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GcatO88986 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GcatO88986 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GcatO88986 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GcatO88986 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GcatO88986 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GcatO88986 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GcatO88986 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GcatO88986 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GcatO88986 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GcatO88986 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GcatO88986 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GcatO88986 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GcatO88986 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GcatO88986 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GcatO88986 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GcatO88986 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GcatO88986 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GcatO88986 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms