Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Tom1O88746 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Tom1O88746 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Tom1O88746 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Tom1O88746 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tom1O88746 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tom1O88746 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tom1O88746 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tom1O88746 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Tom1O88746 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Tom1O88746 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tom1O88746 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Tom1O88746 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tom1O88746 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Tom1O88746 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tom1O88746 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Tom1O88746 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tom1O88746 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Tom1O88746 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tom1O88746 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tom1O88746 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tom1O88746 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tom1O88746 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tom1O88746 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Tom1O88746 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tom1O88746 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tom1O88746 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Tom1O88746 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tom1O88746 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Tom1O88746 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Tom1O88746 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tom1O88746 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tom1O88746 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tom1O88746 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Tom1O88746 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Tom1O88746 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tom1O88746 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tom1O88746 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tom1O88746 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Tom1O88746 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Tom1O88746 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tom1O88746 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Tom1O88746 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tom1O88746 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tom1O88746 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Tom1O88746 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tom1O88746 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tom1O88746 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tom1O88746 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tom1O88746 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms