Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmx1bO88609 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmx1bO88609 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lmx1bO88609 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lmx1bO88609 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmx1bO88609 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmx1bO88609 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms