Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt3bO88509 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt3bO88509 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt3bO88509 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnmt3bO88509 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnmt3bO88509 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnmt3bO88509 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnmt3bO88509 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnmt3bO88509 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnmt3bO88509 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms