Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnmt3aO88508 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnmt3aO88508 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnmt3aO88508 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnmt3aO88508 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3aO88508 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt3aO88508 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnmt3aO88508 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms