Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capns1O88456 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns1O88456 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Capns1O88456 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns1O88456 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capns1O88456 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns1O88456 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms