Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns1O88456 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capns1O88456 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns1O88456 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns1O88456 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Capns1O88456 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Capns1O88456 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns1O88456 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capns1O88456 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capns1O88456 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capns1O88456 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capns1O88456 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms