Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AurkcO88445 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AurkcO88445 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AurkcO88445 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AurkcO88445 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AurkcO88445 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AurkcO88445 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AurkcO88445 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AurkcO88445 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AurkcO88445 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AurkcO88445 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AurkcO88445 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AurkcO88445 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AurkcO88445 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AurkcO88445 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AurkcO88445 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AurkcO88445 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AurkcO88445 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AurkcO88445 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms