Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh16O88338 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdh16O88338 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh16O88338 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh16O88338 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh16O88338 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms