Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nid2O88322 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nid2O88322 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nid2O88322 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nid2O88322 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nid2O88322 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nid2O88322 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nid2O88322 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nid2O88322 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nid2O88322 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nid2O88322 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nid2O88322 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nid2O88322 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nid2O88322 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nid2O88322 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nid2O88322 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nid2O88322 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nid2O88322 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nid2O88322 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nid2O88322 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nid2O88322 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nid2O88322 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nid2O88322 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nid2O88322 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Nid2O88322 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nid2O88322 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Nid2O88322 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nid2O88322 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nid2O88322 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Nid2O88322 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nid2O88322 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nid2O88322 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nid2O88322 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nid2O88322 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nid2O88322 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nid2O88322 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nid2O88322 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms