Protein–RNA interactions for Protein: O70230

Znf143, Zinc finger protein 143, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf143O70230 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf143O70230 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf143O70230 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf143O70230 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf143O70230 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf143O70230 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf143O70230 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf143O70230 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf143O70230 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf143O70230 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf143O70230 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf143O70230 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf143O70230 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf143O70230 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf143O70230 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf143O70230 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf143O70230 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf143O70230 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf143O70230 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf143O70230 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf143O70230 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf143O70230 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf143O70230 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf143O70230 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf143O70230 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf143O70230 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf143O70230 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf143O70230 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf143O70230 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf143O70230 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf143O70230 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms