Protein–RNA interactions for Protein: O55240

Rdh5, 11-cis retinol dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh5O55240 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh5O55240 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh5O55240 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdh5O55240 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rdh5O55240 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh5O55240 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdh5O55240 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdh5O55240 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh5O55240 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rdh5O55240 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms