Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LatO54957 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LatO54957 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LatO54957 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LatO54957 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LatO54957 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LatO54957 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LatO54957 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LatO54957 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LatO54957 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LatO54957 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LatO54957 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LatO54957 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LatO54957 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LatO54957 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LatO54957 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LatO54957 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LatO54957 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LatO54957 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LatO54957 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LatO54957 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LatO54957 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LatO54957 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LatO54957 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LatO54957 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LatO54957 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LatO54957 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LatO54957 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LatO54957 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LatO54957 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LatO54957 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LatO54957 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LatO54957 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LatO54957 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LatO54957 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LatO54957 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LatO54957 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LatO54957 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LatO54957 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LatO54957 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LatO54957 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LatO54957 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LatO54957 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LatO54957 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LatO54957 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LatO54957 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LatO54957 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LatO54957 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LatO54957 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LatO54957 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LatO54957 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LatO54957 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LatO54957 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LatO54957 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LatO54957 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LatO54957 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LatO54957 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LatO54957 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LatO54957 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LatO54957 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LatO54957 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LatO54957 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LatO54957 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LatO54957 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LatO54957 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LatO54957 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LatO54957 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LatO54957 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LatO54957 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LatO54957 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LatO54957 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LatO54957 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LatO54957 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LatO54957 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LatO54957 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LatO54957 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LatO54957 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LatO54957 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LatO54957 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LatO54957 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LatO54957 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LatO54957 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LatO54957 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LatO54957 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LatO54957 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LatO54957 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LatO54957 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LatO54957 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LatO54957 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LatO54957 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LatO54957 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LatO54957 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LatO54957 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LatO54957 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LatO54957 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LatO54957 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LatO54957 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LatO54957 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LatO54957 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LatO54957 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms