Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccr6O54689 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccr6O54689 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccr6O54689 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccr6O54689 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr6O54689 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr6O54689 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr6O54689 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccr6O54689 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccr6O54689 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms