Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl25O35903 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl25O35903 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms