Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf9O35739 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf9O35739 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf9O35739 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf9O35739 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf9O35739 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klf9O35739 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klf9O35739 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf9O35739 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf9O35739 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf9O35739 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf9O35739 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf9O35739 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Klf9O35739 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf9O35739 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf9O35739 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms