Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Stag2O35638 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag2O35638 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Stag2O35638 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag2O35638 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stag2O35638 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stag2O35638 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stag2O35638 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Stag2O35638 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stag2O35638 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Stag2O35638 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stag2O35638 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stag2O35638 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stag2O35638 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stag2O35638 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stag2O35638 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Stag2O35638 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Stag2O35638 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Stag2O35638 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag2O35638 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag2O35638 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag2O35638 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Stag2O35638 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag2O35638 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag2O35638 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag2O35638 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stag2O35638 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stag2O35638 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stag2O35638 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stag2O35638 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stag2O35638 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stag2O35638 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stag2O35638 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stag2O35638 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms