Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx1aO35526 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx1aO35526 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Stx1aO35526 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stx1aO35526 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stx1aO35526 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Stx1aO35526 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms