Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc27a2O35488 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc27a2O35488 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc27a2O35488 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc27a2O35488 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc27a2O35488 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc27a2O35488 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms