Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn6O35454 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcn6O35454 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn6O35454 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn6O35454 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clcn6O35454 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn6O35454 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms