Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CrcpO35427 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CrcpO35427 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CrcpO35427 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CrcpO35427 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CrcpO35427 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CrcpO35427 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CrcpO35427 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CrcpO35427 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CrcpO35427 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CrcpO35427 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CrcpO35427 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CrcpO35427 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CrcpO35427 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CrcpO35427 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CrcpO35427 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CrcpO35427 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrcpO35427 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrcpO35427 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CrcpO35427 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CrcpO35427 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CrcpO35427 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CrcpO35427 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CrcpO35427 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CrcpO35427 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CrcpO35427 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CrcpO35427 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CrcpO35427 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CrcpO35427 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CrcpO35427 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrcpO35427 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CrcpO35427 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CrcpO35427 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CrcpO35427 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CrcpO35427 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CrcpO35427 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CrcpO35427 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CrcpO35427 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CrcpO35427 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms