Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd4O35226 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd4O35226 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd4O35226 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd4O35226 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd4O35226 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd4O35226 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd4O35226 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd4O35226 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd4O35226 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd4O35226 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd4O35226 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd4O35226 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd4O35226 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms