Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpaO35216 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpaO35216 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpaO35216 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CenpaO35216 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpaO35216 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpaO35216 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpaO35216 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpaO35216 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpaO35216 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpaO35216 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpaO35216 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpaO35216 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpaO35216 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpaO35216 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpaO35216 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpaO35216 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpaO35216 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpaO35216 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CenpaO35216 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms