Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-M9O19442 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-M9O19442 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-M9O19442 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-M9O19442 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2-M9O19442 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
H2-M9O19442 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-M9O19442 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-M9O19442 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-M9O19442 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-M9O19442 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-M9O19442 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-M9O19442 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-M9O19442 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-M9O19442 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms