Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fpr-s1O08790 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fpr-s1O08790 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fpr-s1O08790 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fpr-s1O08790 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fpr-s1O08790 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fpr-s1O08790 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fpr-s1O08790 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fpr-s1O08790 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fpr-s1O08790 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fpr-s1O08790 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms