Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna2d1O08532 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacna2d1O08532 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d1O08532 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna2d1O08532 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna2d1O08532 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna2d1O08532 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d1O08532 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms