Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ZSWIM7-212ENST00000491631 879 ntTSL 222.13■■□□□ 1.137e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.127e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-210ENST00000486706 918 ntTSL 1 (best)21.77■■□□□ 1.087e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-216ENST00000579955 566 ntTSL 421.77■■□□□ 1.087e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-203ENST00000460252 682 ntTSL 220.17■□□□□ 0.827e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-218ENST00000585208 987 ntTSL 1 (best)20.16■□□□□ 0.823e-10■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-211ENST00000490395 1264 ntTSL 1 (best)19.98■□□□□ 0.797e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-206ENST00000474716 671 ntTSL 319.93■□□□□ 0.783e-10■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-217ENST00000584519 677 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-10■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-215ENST00000497719 721 ntTSL 516.72■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-208ENST00000476496 969 ntTSL 316.02■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-213ENST00000495825 558 ntTSL 311.1□□□□□ -0.637e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-202ENST00000399280 1869 ntTSL 310.87□□□□□ -0.677e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.153e-10■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 GGH-208ENST00000523788 492 ntTSL 221.77■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 GGH-204ENST00000518966 574 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 GGH-205ENST00000520609 1109 ntTSL 212.32□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.162e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.12e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 GAL3ST1-214ENST00000431313 851 ntTSL 313.42□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 67.9
DDX3XO00571 BCAP29-214ENST00000486326 512 ntTSL 225.49■■□□□ 1.671e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.11e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 BCAP29-217ENST00000494086 1075 ntTSL 318.74■□□□□ 0.591e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 BCAP29-213ENST00000482371 943 ntTSL 318.03■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.251e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 BCAP29-212ENST00000479917 746 ntTSL 37.02□□□□□ -1.291e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 BCAP29-210ENST00000466094 793 ntTSL 26.81□□□□□ -1.321e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 BCAP29-206ENST00000442065 812 ntTSL 36□□□□□ -1.451e-10■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.986e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-209ENST00000507773 1320 ntTSL 520■□□□□ 0.796e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-202ENST00000435059 910 ntTSL 219.49■□□□□ 0.716e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-219ENST00000515850 862 ntTSL 518.79■□□□□ 0.66e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-214ENST00000509781 806 ntTSL 218.54■□□□□ 0.566e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-216ENST00000511763 581 ntTSL 317.76■□□□□ 0.436e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-204ENST00000502406 1477 ntTSL 215.32■□□□□ 0.046e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-205ENST00000503334 943 ntTSL 313.23□□□□□ -0.296e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-210ENST00000508520 845 ntTSL 510.94□□□□□ -0.666e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-211ENST00000508607 529 ntTSL 210.65□□□□□ -0.76e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-218ENST00000514907 633 ntTSL 59.57□□□□□ -0.886e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SLC35B1-215ENST00000511657 548 ntTSL 39.01□□□□□ -0.976e-36■■■■■ 67.8
DDX3XO00571 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.523e-14■■■■■ 67.7
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DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-212ENST00000636089 2230 ntTSL 524.62■■□□□ 1.533e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-201ENST00000463721 1836 ntTSL 223.7■■□□□ 1.393e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-226ENST00000637696 2373 ntTSL 522.98■■□□□ 1.273e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-219ENST00000636942 1696 ntTSL 522.54■■□□□ 1.23e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-208ENST00000635951 2168 ntTSL 521.71■■□□□ 1.073e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-204ENST00000497128 914 ntTSL 221.53■■□□□ 1.043e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-203ENST00000486081 1135 ntTSL 521.48■■□□□ 1.033e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-217ENST00000636718 2499 ntTSL 521.44■■□□□ 1.023e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-209ENST00000635952 853 ntTSL 320.99■□□□□ 0.953e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-207ENST00000635946 2459 ntTSL 520.76■□□□□ 0.913e-9■■■■■ 67.7
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 67.7
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DDX3XO00571 ATP5E-202ENST00000395659 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-69■■■■■ 67.6
DDX3XO00571 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.923e-69■■■■■ 67.6
DDX3XO00571 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.761e-9■■■■■ 67.5
DDX3XO00571 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.624e-18■■■■■ 67.5
DDX3XO00571 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 518.58■□□□□ 0.574e-18■■■■■ 67.5
DDX3XO00571 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -04e-18■■■■■ 67.5
DDX3XO00571 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.324e-18■■■■■ 67.5
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DDX3XO00571 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-12■■■■■ 67.3
DDX3XO00571 C5orf15-202ENST00000507191 635 ntTSL 211.92□□□□□ -0.53e-12■■■■■ 67.3
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DDX3XO00571 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.553e-17■■■■■ 67.3
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DDX3XO00571 KCTD20-203ENST00000443316 406 ntTSL 217.52■□□□□ 0.43e-29■■■■■ 67.3
DDX3XO00571 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.333e-17■■■■■ 67.3
DDX3XO00571 KCTD20-207ENST00000481911 1494 ntTSL 214.92□□□□□ -0.023e-17■■■■■ 67.3
DDX3XO00571 KCTD20-208ENST00000483557 578 ntTSL 46.42□□□□□ -1.383e-17■■■■■ 67.3
DDX3XO00571 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.074e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.724e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.494e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 RNPEPL1-203ENST00000451363 538 ntTSL 415.32■□□□□ 0.044e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 GYG1-207ENST00000478067 476 ntTSL 413.47□□□□□ -0.254e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.34e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 GYG1-210ENST00000484197 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 GYG1-203ENST00000461191 866 ntTSL 211.34□□□□□ -0.594e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 GYG1-212ENST00000492285 657 ntTSL 49.82□□□□□ -0.844e-15■■■■■ 67.2
DDX3XO00571 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 67.1
DDX3XO00571 SLC8B1-209ENST00000549605 850 ntTSL 320.25■□□□□ 0.835e-10■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 SLC8B1-203ENST00000548186 996 ntTSL 319.93■□□□□ 0.785e-10■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 SLC8B1-204ENST00000548477 2053 ntTSL 219.62■□□□□ 0.735e-10■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 SLC8B1-207ENST00000549181 925 ntTSL 319.34■□□□□ 0.695e-10■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 SLC8B1-212ENST00000551230 549 ntTSL 418.29■□□□□ 0.525e-10■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.35e-10■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-10■■■■■ 66.5
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