Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm20878L7N244 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm20878L7N244 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20878L7N244 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20878L7N244 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20878L7N244 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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