Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2al1oL7MU04 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2al1oL7MU04 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2al1oL7MU04 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2al1oL7MU04 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2al1oL7MU04 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2al1oL7MU04 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2al1oL7MU04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2al1oL7MU04 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H2al1oL7MU04 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms