Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21060J3KMU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21060J3KMU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21060J3KMU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms