Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r67G5E8C1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r67G5E8C1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r67G5E8C1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r67G5E8C1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r67G5E8C1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms