Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r58G3X9U3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmn1r58G3X9U3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r58G3X9U3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r58G3X9U3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r58G3X9U3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms