Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim55G3X8Y1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim55G3X8Y1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim55G3X8Y1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim55G3X8Y1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim55G3X8Y1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms