Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r39G3UWE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r39G3UWE6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r39G3UWE6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r39G3UWE6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn1r39G3UWE6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r39G3UWE6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms