Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r76F8VQ63 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r76F8VQ63 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r76F8VQ63 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r76F8VQ63 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r76F8VQ63 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms