Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Usp32F8VPZ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Usp32F8VPZ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Usp32F8VPZ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Usp32F8VPZ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Usp32F8VPZ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp32F8VPZ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp32F8VPZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp32F8VPZ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp32F8VPZ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Usp32F8VPZ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Usp32F8VPZ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Usp32F8VPZ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp32F8VPZ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp32F8VPZ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Usp32F8VPZ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms