Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm2564F6Z9S8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm2564F6Z9S8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm2564F6Z9S8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2564F6Z9S8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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