Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zfp946F6VWU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp946F6VWU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp946F6VWU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp946F6VWU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms