Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
4930451I11RikE9Q9R3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930451I11RikE9Q9R3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930451I11RikE9Q9R3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930451I11RikE9Q9R3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms