Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TrdnE9Q9K5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TrdnE9Q9K5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TrdnE9Q9K5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TrdnE9Q9K5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TrdnE9Q9K5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TrdnE9Q9K5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TrdnE9Q9K5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TrdnE9Q9K5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TrdnE9Q9K5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TrdnE9Q9K5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TrdnE9Q9K5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TrdnE9Q9K5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TrdnE9Q9K5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TrdnE9Q9K5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms