Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Aknad1E9Q8N6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Aknad1E9Q8N6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Aknad1E9Q8N6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Aknad1E9Q8N6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Aknad1E9Q8N6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Aknad1E9Q8N6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Aknad1E9Q8N6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Aknad1E9Q8N6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Aknad1E9Q8N6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms