Protein–RNA interactions for Protein: E9Q634

Myo1e, Unconventional myosin-Ie, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1eE9Q634 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myo1eE9Q634 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myo1eE9Q634 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myo1eE9Q634 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo1eE9Q634 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo1eE9Q634 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myo1eE9Q634 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo1eE9Q634 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo1eE9Q634 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myo1eE9Q634 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myo1eE9Q634 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo1eE9Q634 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo1eE9Q634 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myo1eE9Q634 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Myo1eE9Q634 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo1eE9Q634 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms