Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ythdc1E9Q5K9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ythdc1E9Q5K9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ythdc1E9Q5K9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ythdc1E9Q5K9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ythdc1E9Q5K9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ythdc1E9Q5K9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ythdc1E9Q5K9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms