Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
8030474K03RikE9Q4Y8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
8030474K03RikE9Q4Y8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
8030474K03RikE9Q4Y8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
8030474K03RikE9Q4Y8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
8030474K03RikE9Q4Y8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
8030474K03RikE9Q4Y8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
8030474K03RikE9Q4Y8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
8030474K03RikE9Q4Y8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms