Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930546C10RikE9Q4Y3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930546C10RikE9Q4Y3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930546C10RikE9Q4Y3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930546C10RikE9Q4Y3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms