Protein–RNA interactions for Protein: E9Q286

Ice1, Little elongation complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ice1E9Q286 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ice1E9Q286 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ice1E9Q286 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ice1E9Q286 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ice1E9Q286 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ice1E9Q286 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ice1E9Q286 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ice1E9Q286 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ice1E9Q286 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ice1E9Q286 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ice1E9Q286 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ice1E9Q286 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ice1E9Q286 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ice1E9Q286 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms