Protein–RNA interactions for Protein: E9PZG0

Apol11a, Apolipoprotein L 11a, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol11aE9PZG0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol11aE9PZG0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apol11aE9PZG0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apol11aE9PZG0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol11aE9PZG0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol11aE9PZG0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol11aE9PZG0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol11aE9PZG0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol11aE9PZG0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol11aE9PZG0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol11aE9PZG0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol11aE9PZG0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol11aE9PZG0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol11aE9PZG0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol11aE9PZG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1017.9 ms