Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp4E9PYK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp4E9PYK3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp4E9PYK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Parp4E9PYK3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Parp4E9PYK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Parp4E9PYK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Parp4E9PYK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms