Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl3lE9PWZ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl3lE9PWZ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl3lE9PWZ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl3lE9PWZ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl3lE9PWZ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms