Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trim30dE9PWL0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Trim30dE9PWL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trim30dE9PWL0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trim30dE9PWL0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trim30dE9PWL0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim30dE9PWL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim30dE9PWL0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim30dE9PWL0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim30dE9PWL0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim30dE9PWL0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Trim30dE9PWL0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim30dE9PWL0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim30dE9PWL0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim30dE9PWL0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1337.8 ms